هجوم سیل در جنوب افریقا باعث حاد شدن بحران سلامت و غذای میلیون ها نفر شده است. به خاطر پیش بینی ادامه بارندگی تا آخر ماه سپتامبر که باعث افزایش بیماریهای مالاریا، اسهال و سایر بیماریهای مسری کشنده می شود ، کمک های بین المللی لازم وضروری اعلام شده است. سیل های سالیانه جنوب افریقا نه تنها موجب تهدید مردم این سرزمین در مقابل بیماریهای مسری شده است ، بلکه بحران  سوئ تغذیه مردم این منطقه را نیز تحت تاثیر قرار می دهد. در حال حاضر کشورهای بنین، توگو، نیجریه، بورکینافاسو و موریتانیا به کمک های اورژانسی و ضروری نیازمندند. سیل باعث تخریب وسیع پل ها ، جاده ها، خطوط راه آهن و سایر مسیرهای اصلی برای تحویل خدمات بهداشتی و ملزومات انسانی گردیده است. سازمان بهداشت جهانی در حال حاضر فراهم آوری داروهای ضروری ، سنجش وضعیت سلامت جمعیت آسیب پذیر به خصوص بچه ها ، زنان و بزرگسالان،و کمک به تقویت بودجه مردمی را به عهده گرفته است. در حدود 418 میلیون دلار برای کمک به این منطقه در خواست شده است که از این مقدار 76 میلیون دلار بابت مراقبت های پزشکی برآورد شده و تاکنون تنها 22% ا ز این مقدار تامین شده است. بیماریهای اپیدمیک و بومی در جنوب افریقا رایج است . به خصوص بیماریهای مالاریا عامل اصلی بیماری و مرگ د راین منطقه است. مننژیت ، وبا و تب زرد از دیگر بیماریهایی است که سالیانه سلامت افراد زیادی را در این منطقه در معرض خطر قرار داده است. سیل اخیر نیز احتمال ابتلا به این بیماریها را تشدید کرده است. همچنین حدود 5 میلیون نفر از مردم این منطقه مبتلا به ایدز می باشند که بحران اخیر وضعیت سلامت و مراقبت آنها را به خطر انداخته است. خرابی زمین های کشاورزی و از دست رفتن غلات باعث شدیدتر شدن بحران کمبود غذا در این منطقه گردیده است. کشورهای جنوب افریقا از جمله کشورهای در معرض خطر بحران غذا هستند که توسط سازمان بهداشت جهانی شناسایی شده اند. نیجریه ، مالی و بورکینافاسو در اول لیست این کشورها قرار دارند که  در حدود 10 % از کودکان زیر 5 سال آن به خاطر سوئ تغذیه حاد و 40% درصد به خاطر سوئ تغذیه مزمن رنج می برند. سوئ تغذیه حاد در مقایسه با سوئ تغذیه مزمن به طور سریع در بین مردم ضعیف توسعه یافته و باعث کاهش وزن و افزایش مرگ و میر می شود در حالیکه سوئ تغذیه مزمن در طول زمان بیشتر توسعه می یابد و قد و توانایی یادگیری افراد را تحت تاثیر قرار می دهد.هجوم سیل  در کشور بنین     باعث آوارگی 150 هزار نفر و توسعه مالاریا، بیماری های اسهالی و عفونت های تنفسی به خصوص در بین کودکان شده است. سازمان بهداشت جهانی مسئولیت تامین آب شرب سالم ، تامین بهداشت و توزیع دارو و واکسناسیون کودکان در مقابل بیماری سرخک را به عهده گرفته است. گفتنی است که در کشورنیجریه نیز 24 هزار نفر و در کشور توگو 12 هزار نفر به خاطر سیل آواره شده اند.